1、专利权侵权案件审理期限延长，审理难度加大，而且侵权人往往利用该期间继续侵权。由于专利复审委员会进行无效宣告请求案件的审理周期较长，一般要一年以上的时间;对发明专利来讲，如果不服专利复审委员会的决定，还可以向北京市中级人民法院起诉。这就会使某些专利权人从提起侵权控诉时起，到被告提出无效宣告请求，以及无效案件审结，再到侵权案件的恢复审理及其审结，少则2—3年，多则4—5年。而在此期间，侵权人往往继续侵权却得不到限制，法院也面临取证的困难。
  2、侵权被告多为中小型企业，很容易转移资产，抽逃资金或采取其他逃避承担侵权责任的措施，从而使其不能及时受到法律的制裁，专利权不能得到及时、切实的法律保护。
  3、无效宣告请求被被告人作为拖延诉讼的重要手段，使人民法院不能及时审结案件，造成人力、物力、财力的浪费，与诉讼经济原则背道而驰。并且，由于侵权案件不能及时结案，侵权人往往因此“受益匪浅”，在一定程度上助长了其侵权气焰，使侵权现象日益增多，专利侵权案件也随之增加，有恶性循环之势。
  4、专利权的无效宣告请求，使专利权处于不确定的状态，专利权的有效实施受到影响。专利权的许可使用，专利权转让事实上不可能进行，直接影响专利权人的利益;而且会使其他人 在该期间无偿实施该专利而不能限制。