首先，虽然国家知识产权局不再要求请求人提交检索报告，请求人仅需提交现有技术或现有设计信息材料，但部分申请人依然会进行检索，从而增加了专利申请成本；
  其次，优先审查的发明专利申请在第一次审查意见通知书发文日起仅有两个月的答复期限，相对于正常程序的发明专利申请收到第一次审查意见通知书起的四个月答复期限，缩短了约两个半月，这使专利申请人和专利代理机构的应对审查意见的答复时间更加匆忙，甚至因为仓促答复、没有答在要点上而收到下一次审查意见；如果发明专利申请的第一次审查意见答复的时间自第一次审查意见通知书发文日起超过两个月，但又在收到第一次审查意见通知书起的四个月答复答复的话，则会被自动转为常规审查程序，从而丧失了优先审查的机会；
  最后，对于审查员而言，自同意优先审查之日起，发明专利申请在45日内发出第一次审查意见通知书并在一年内结案，这将意味着优先审查的发明专利申请至多收到两次至三次审查意见通知书，就必须得出授权或者驳回的审查决定，相对于正常程序的发明专利申请，不可能收到类似于第四次甚至第五次审查意见，因此，很可能因为时间仓促导致审查员对发明专利申请的审查不彻底而做出对专利申请人不利的审查决定。
  此外，关于常规的提前公开的利弊，专利申请人在选择提前公开与否的同时，应该结合企业的实际情况，从长远的角度慎重考虑，不要盲目选择提前公开，以免造成不必要的损失【5】。